Regulovat funkci bílkovin

Kaspáza může působit na několik enzymů nebo proteinů souvisejících s regulací cytoskeletu za účelem změny buněčné struktury. Patří mezi ně gelsin, fokální adhezní kináza (FAK), P21 aktivovaná kináza (PAK) atd. Štěpení těchto proteinů vede k poklesu jejich aktivity. Například kaspáza může štěpit a koagulovat kolagen za vzniku fragmentů, takže není schopen regulovat cytoskelet přes aktinová vlákna.

Kromě toho může kaspáza také inaktivovat nebo downregulovat enzymy, sestřihové proteiny mRNA a proteiny zesíťující DNA související s opravou DNA. Vlivem DNA je funkce těchto proteinů inhibována, což brání proliferaci a replikaci buněk a vede k apoptóze.

To vše naznačuje, že kaspáza „ničí“ buňky uspořádaným způsobem. Přerušují spojení mezi buňkami a jejich okolím, narušují cytoskelet, blokují replikaci a opravu DNA, zasahují do sestřihu mRNA, poškozují DNA a jadernou strukturu, indukují buňky k expresi signálů, které mohou být spolknuty jinými buňkami, a dále je degradují do apoptotických těl.